總氮難處理的原因主要是碳源不足，而現有的工藝對總氮去除有難度。導致總氮去除效果不明顯，目前我國絕大部分污水處理廠還很缺乏控制總氮,氨氮有效手段，硝化系統的處理效果的有很大程度上是依賴于季節的變換更替，部分污水處理廠提高硝化的效果僅僅是簡單地減少排泥或者增加曝氣量，遠遠沒有達到優化運行的效果。
當污水處理廠設備能力和運行參數存在一定可供調節的空間時，我們也可通過提高溶解氧濃度、延長污泥齡、降低污泥負荷等方法強化生物硝化能力；同時還可通過控制溶解氧、投加碳源、加大回流比和延長反硝化時間方法強化反硝化，從而減弱北方低溫對生物脫氮的影響，使NH3－N 和TN 穩定達標。
另外還需要大力加強對污水處理廠運行人員的技術培訓,提高污水處理廠管理運行的技術水平和智能控制水平。