印染廢水中纖維較多，污染物成分復雜，水質波動大，處理難度較大，而且隨著園區的發展， 水質和水量發生變化， 在運行過程中可能會發生一系列問題，主要有：
① 加酸系統設計容量偏小，加酸量不夠；加酸泵容易被腐蝕。
② 預處理系統容易發生堵塞現象，例如進廠污水管道容易淤積泥沙，清淤工作量大；粗細格柵撈渣效果差且易被棉紗、纖維等纏繞和堵塞；平流沉砂池吸砂泵經常發生堵塞；砂水分離器出啥效果差；調節沉淀池吸泥泵與排泥泵易堵塞等。
③ 水量波動大，導致曝氣池易受到負荷沖擊，活性污泥活性變差，出水水質易發生波動。
④ 氧化溝曝氣量不足，表面曝氣機容易跳閘，且水量大時易超電流。
⑤ 鼓風機曝氣系統故障多，例如鼓風機基礎下沉，導致鼓風機機身傾斜；鼓風機濾網易堵塞，經常發生喘振現象。
⑥ 水解酸化池潛水攪拌機功率偏小，發生污泥沉積。
⑦ SVI 值偏高，二沉池時有細小污泥外漂現象。
⑧ 污泥脫水機濾帶經常破損，污泥脫水機效率低。